2016年3月3日/生物谷BIOON/--在一项新的研究中，美国迈阿密大学米勒医学院西尔维斯特综合癌症中心眼癌部位小组负责人J. William Harbour博士和同事们发现一种生物标志物能够鉴定出葡萄膜黑色素瘤（uveal melanoma）有更高风险发生转移的病人。在归类为1级的葡萄膜黑色素瘤中，含有高水平的被称作PRAME mRNA的生物标志物的病人要比含有低水平PRAME mRNA的那些病人更可能发生转移，这表明更加密切地监控病人体内的这种生物标志物从而有助监控转移是否发生。相关研究结果发表在2016年3月1那期Clinical Cancer Research期刊上，论文标题为“PRAME as an Independent Biomarker for Metastasis in Uveal Melanoma”。
这项研究估计，低水平PRAME mRNA的1级葡萄膜黑色素瘤病人的五年转移率是0，而高水平PRAME mRNA的1级葡萄膜黑色素瘤病人的五年转移率是38%。这项研究建立在2004年Harbour 鉴定出的1级和2级葡萄膜黑色素瘤。
根据Harbour的说法，在美国，每年诊断出大约2,000～3,000例葡萄膜黑色素瘤病例。他解释道，葡萄膜黑色素瘤是根据基因表达谱而被分为1级和2级，而且相比于2级，1级有更低的几率发生转移。
Harbour说，“然而，大约10%的1级葡萄膜黑色素瘤病人确实发生转移。这项研究的主要目的是在这小部分1级葡萄膜黑色素瘤中鉴定出一种临床有用的生物标志物，这可能有助于为黑色素瘤病人开发出精准医疗方法。”
Harbour继续说道，“我们吃惊地发现单独一种生物标志物--- PRAME---足以鉴定出这一小部分具有增加的转移风险的1级葡萄膜黑色素瘤病人。这些发现可能马上就会产生临床影响。这些数据暗示着相比于没有PRAME 表达的1级葡萄膜黑色素瘤病人，PRAME 表达水平增加的1级葡萄膜黑色素瘤病人应当得到不同的管理。应当更加密切地监控他们是否发生转移，而且应当考虑为他们制定辅助疗法的临床试验。”
Harbour和同事们对从5名发生转移的1级葡萄膜黑色素瘤病人和8名没有发生转移的1级葡萄膜黑色素瘤病人体内分离的mRNA进行全基因组分析。在发生转移的1级葡萄膜黑色素瘤中，最为高度过量表达的mRNA是PRAME。对PRAME mRNA水平的进一步分析证实在7名发生转移的1级葡萄膜黑色素瘤病人中，有7人具有高水平的PRAME mRNA，而在19名未发生转移的1级葡萄膜黑色素瘤病人中，有16人具有最低水平的PRAME mRNA。
在64例1级葡萄膜黑色素瘤样品中，39例（61%）样品具有低水平的PRAME mRNA（PRAME阴性），25例（39%）样品具有高水平的PRAME mRNA（PRAME阳性）。在这些PRAME阴性的1级葡萄膜黑色素瘤病人中，没有人发生转移，而在这些PRAME阳性的1级葡萄膜黑色素瘤病人中，有7人发生转移。
为了验证高水平的PRAME mRNA与1级葡萄膜黑色素瘤转移之间的关联性，研究人员分析了另外两种数据集。第一种数据集由两个独立发布的数据集组合而成，第二种数据集是荷兰莱顿大学建立的一种数据集。在这两种数据集中，相比于PRAME阴性的1级葡萄膜黑色素瘤，PRAME阳性的1级葡萄膜黑色素瘤有显著高的转移风险。（生物谷 Bioon.com）
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doi:10.1158/1078-0432.CCR-15-2071
PRAME as an Independent Biomarker for Metastasis in Uveal Melanoma
Matthew G. Field1, Christina L. Decatur1, Stefan Kurtenbach1, Gülçin Gezgin2, Pieter A. van der Velden2, Martine J. Jager2, Kaleigh N. Kozak1, and J. William Harbour
Purpose: Uveal melanoma (UM) can be classified by gene expression profiling (GEP) into Class 1 (low metastatic risk) and Class 2 (high metastatic risk), the latter being strongly associated with mutational inactivation of the tumor suppressor BAP1. Nevertheless, a small percentage of Class 1 tumors give rise to metastatic disease. The purpose of this study was to identify biomarkers of metastasis in Class 1 tumors.
Experimental Design: A total of 389 consecutive patients with UM were assigned to Class 1 or Class 2 using a prospectively validated 12-gene prognostic classifier. Selected tumors were further analyzed using global GEP and single nucleotide polymorphism microarrays. PRAME (preferentially expressed antigen in melanoma) mRNA expression was analyzed in 64 Class 1 tumors by qPCR.
Results: Among Class 1 UMs, the most significant predictor of metastasis was PRAME mRNA expression (P = 0.0006). The 5-year actuarial rate of metastasis was 0% for Class1PRAME−, 38% for Class1PRAME+, and 71% for Class 2 tumors. Median metastasis-free survival for Class1PRAME+ patients was 88 months, compared to 32 months for Class 2 patients. Findings were validated using three independent datasets, including one using disomy 3 to identify low-risk UM. Chromosome copy number changes associated with Class1PRAME+ tumors included gain of 1q, 6p, 8q, and 9q and loss of 6q and 11q. PRAME expression was associated with larger tumor diameter (P = 0.05) and SF3B1 mutations (P = 0.003).
Conclusions: PRAME is an independent prognostic biomarker in UM, which identifies increased metastatic risk in patients with Class 1 or disomy 3 tumors. This finding may further enhance the accuracy of prognostic testing and precision medicine for UM.
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